多年前，孙燕教授曾一直致力于中药克制肿瘤的研究。在和记者交流中，孙燕院士如数家珍地介绍说，目前我国有12000多种中药材和万余个中药处方，尽管中药有着很好的疗效，但由于复杂的化学成分、广泛的药理作用，致使临床药效定位、药物控制标准及配伍规律往往不明确。这就需要借助现代科技手段，把散落的数据组织起来，搞清处方的活性组分结构和方剂配伍奥秘。

孙燕院士指出，那种单纯依靠中药治愈肿瘤的想法是不切实际的，利用中药辅助治疗肿瘤才不失为科学的态度。比如，传统中药黄芪、芦笋、女贞子、仙灵脾可促进病人免疫功能的恢复，保护肾上腺和骨髓功能。民间被视为毒药的“砒霜”中，可提取出一些有效成分，从静脉注射到血液中就可以治疗某些类型的白血病。部分中药还能很好地改善临床症状，提高远期疗效，甚至在一定程度上能稳定或缩小肿瘤组织。大量的临床病例证明，佐以中医中药，癌症患者10年生存率可以提高15%。

一个事实是，中医中药在很长的一段时间走入误区，甚至出现浮夸风。提起目前市场上某些大肆宣传的抗肿瘤药物，孙燕教授十分气愤。他认为，这些夸大的、不负责任的宣传，是在拦路抢劫和谋财害命。而许多患者偏听偏信，过分受广告诱导和误导，结果往往丧失了最佳的治疗时机。同样地，有人因此动辄提出废弃中医，更是偏激和无知的表现。中药完全可以调理肌肤，扶正祛邪，平衡阴阳，提高机体免疫力和抗病能力。

“中医中药在抗肿瘤中是大有作为的，问题是，中医药一定要摆正自己的位置，甘当‘配角’，乐于‘助攻’，不可偏离‘辅助’二字。临床无数事例早已说明，科学合理地辅以中药，可明显降低放化疗反应，促进手术恢复，减少复发转移，延长肿瘤患者的生存期。”孙燕院士如是说。