拥有多种先进医疗设备主要有:美国雅培免疫分析系统雅培全自动生化分析仪美国产GE彩超血气分析仪特定蛋白分析仪瑞典产血液透析机三维立体放疗系统人工肝支持系统美国数字胃肠X光机钴60治疗机X线模拟定位仪腔内后装治疗机以及德国西门子全身CT等
南京市传染病医院南京市第二医院由原南京市钟阜医院和南京市传染病医院于1996年合并组建1997年通过省卫生厅评审成为江苏省唯一的三级传染病医院现为东南大学医学院附属医院南京大学医学院南京医科大学教学医院镇江医学院检验系教学基地徐州医学院和苏州医学院硕士生培养点医院分设钟阜部(院机关所在地)和紫竹林部占地近8万平方米建筑面积近6万平方米院内树木葱茏百花争艳环境优美是一座典型的花园式医院
南京市传染病医院现有职工729人卫技人员占75%高级专家兼职教授66人其中省定333工程人才3人省市科委跨世纪人才7人临床研究生13人编制床位600张分设16个病区其中钟阜部10个病区380张床位主要收治各种法定传染病设有肝内科外科妇产科龟头瘙痒疾病传染杂病科中西医结合科麻醉科等临床科室门诊部设有相应的专科及专家特色门诊为适用疾病谱变化以及社会需求充分利用卫生资源医院在紫竹林部增设南京市肿瘤医院与南京市老年病医院编制床位220张分设6个病区主要收治肿瘤病及老年病设有肿瘤内科外科老年病科以及社区服务部其门诊部除设有相应的专科外还设有动宠物咬伤疫门诊性病门诊等
南京市传染病医院现有固定资产4800万元 南京市传染病医院承担了南京地区及周边省市传染病诊治任务医院以医疗服务为重点狠抓医疗质量为病人提供高水平专科医疗服务近年来在病毒性肝炎肝硬化脂肪肝乙脑流脑等传染病的诊治以及狂犬病的免疫预防方面进行了系列研究和临床实践临床治愈率均有较大提高同时医院加强重点科室------肝病内科肝炎产科传染病科和检验科的建设积极发挥重点科室在医教研等方面的积极作用
南京市传染病医院坚持科教兴院拥有一批省内外有影响的传染病诊治专家其中多人担任全国省市传染病学术团体负责人努力开展临床应用性研究和科技开发与国内外医学院校建立广泛的科研合作关系先后与美国布朗大学日本名古屋市立大学医学院进行科研合作近三年以表省级以上论文342篇近五年获科研成果奖23项其中省部级10项市厅级13项
南京二院治疗肝炎八大特色 1 人工肝治疗重症肝炎 2 穴位注射治疗肝炎 3 高压氧治疗肝炎 4 重症监护治疗肝功能衰竭 5 消除腹水有办法 6 手术治疗门脉高压症 7 注射硬化剂止血 8 抗病毒治疗肝炎
南京市传染病医院十分重视医德医风建设1986年1995年两次荣获全国卫生系统先进集体;1992年以来连续七年保持了省文明单位的光荣称号;1985年以来连续14年保持南京市文明单位称号;先后多次荣获省行风先进单位且荣获市白求恩杯竞赛综合大奖第一名