慢性细菌性前列腺炎临床上很难根治。一般采用综合治疗，疗程多为2～3个月。
 
1.一般治疗
 
解除思想上的不安和顾虑，安排健康规律的勃起障碍和生活，参加适当的体育锻炼，热水坐浴，定期前列腺按摩对本病都有一定的作用。
 
2.抗生素的治疗
 
要选择能够进入前列腺组织内脂溶性又好的药物，针对病原体治疗，主要依据细菌培养和药敏试验选用合理的抗生素。复方新诺明较易进入前列腺组织，达到有效的抗菌浓度，常作为临床首选药物，每次2片，每日二次，建议服用4～8周，以达到最好的疗效。其它效果较好的还有如吡哌酸、氟哌酸、环丙氟哌酸、红霉素、先锋霉素等，这些药物治疗效果好，但停药后易复发。也有人建议长期或终生服用。为防止细菌对某种抗生素产生耐药，可每隔10～15天更换使用一种抗生素。
 
3.局部治疗
 
(1)前列腺按摩：按摩的方法是：让患者取膝胸位，术者右手食指戴橡皮指套，涂以石蜡油。先轻轻按摩肛周，然后，食指缓缓伸入直肠内，通过直肠粘膜间接摸到前列腺腺体后叶，用食指的最末指节对着前列腺的后叶，从外从上向内向下对前列腺进行按压，即先从腺体的两侧向中线各按压3～4次，再从中央沟自上而下向尿道外口按压出前列腺液。一般每周按摩1～2次，4～8次为一疗程。可持续2～3个疗程。按摩时手法应“轻、缓”，切忌粗暴地反复强力按压，以免造成前列腺组织新的损伤，使炎症加重，甚至产生毒副反应，使病情加重。故多主张按摩后应立即排尿，可使积留于后尿道的炎性分泌物随尿液排出。慢性前列腺炎急性发作期间禁忌作前列腺按摩，以免引起炎症扩散。前列腺萎缩、硬化者不宜用按摩疗法。疑为前列腺结核、肿瘤的患者，前更腺按摩亦均属禁忌。一般按摩后，病人感觉舒畅，尿道滴白症状可减轻或消失。如果按摩后出现发热或症状加重，则应暂停按摩并加用抗生素治疗。
 
(2)热水坐浴：将臀部和前阴尽量浸泡在热水中，水温控制在42～43℃，每日1～2次，每次15～20分钟。或可用内服中药的第三次煎液或用朴硝100g溶于沸水2000ml中，待水温在42～43℃时，每次坐浴20分钟左右。这一疗法可改善局部血循环，促使炎症吸收，对会阴部疼痛等局部症状的改善有明显效果。
 
(3)前列腺热疗：近年来研制出了经尿道或经直肠的前列腺微波或射频治疗机，对慢性细菌性前列腺炎有一定的疗效。使用前列腺射频治疗仪时，将射频电极插入尿道前列腺部，另一电极放置耻骨上区。治疗温度为42～43℃，一次时间为2小时。治疗后口服前列腺液细菌培养敏感的抗生素。半月之后可重复治疗。
 
4.对症治疗：有膀胱、尿道剌激症状及尿末滴白者，黄酮哌脂片一次0.2，每日三次；或用特拉唑嗪2mg，每晚1次；或用普鲁本辛一次15mg，一日三次。有疼痛症状可用消炎痛一次25mg，一日三次。有神经衰弱者可用谷维素一次10～30mg，一日三次。有阳痿者可短期应用丙酸睾丸酮肌注，一次25mg，一周二次。适当给予安慰剂。
 
5.复合蛋白锌：近年来有一些锌制剂治疗慢性细菌性前列腺炎的报导。复合蛋白锌是一种有机微量元素复合物，有利于机体的吸收，有效的提高血锌浓度，起到局部抗菌作用，另外锌还是前列腺抗菌因子(PFA)的主要成份，参与前列腺的抗菌防御机制。使用方法，复合蛋白锌一次1.2g，饭前15分钟白开水吞服，每日.次，连用4周。